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L'aéroport de Patagonie (PUQ) est le principal point de départ des expéditions antarctiques avec soutien aérien et de nombreuses croisières. Le terminal est compact et facile d'accès, et la plupart des vols intérieurs au départ de Santiago sont assurés par LATAM et JetSMART. Les retards dus aux conditions météorologiques sont fréquents au printemps et en été, en raison des vents particulièrement imprévisibles de Patagonie ; prévoyez donc une marge de temps suffisante pour vos correspondances.

L'aéroport d'Ushuaia est le principal point de départ de la plupart des croisières en Antarctique, car il se situe à l'extrémité sud de l'Argentine et permet de gagner deux jours sur la traversée du passage de Drake. Les compagnies Aerolíneas Argentinas et LATAM assurent des liaisons entre Ushuaia et Buenos Aires. Le terminal unique est souvent très fréquenté de novembre à mars ; il est donc conseillé d'arriver bien à l'avance.